目前，研究院共组建6个科研团队，分别是海洋能发电研究团队、海洋观测-成像技术研究团队、海洋环境保护与生态工程研究团队、智能船舶与绿色制造研究团队、海洋地质资源与工程研究团队和海洋工程环境研究团队。

海洋研究院正在进一步加强科研队伍建设，汇聚海内外高端人才，优化科研队伍结构，增强科研核心竞争力，力争到2019年，基本建成一支结构合理、固定与流动、专职与兼职相结合的科研队伍，实现人才目标70%以上，到2020年全面实现人才目标。